Search results for "apvalka proteīns"
showing 5 items of 5 documents
Smiltsērkšķu marafivīrusa kodēto proteīnu klonēšana, ekspresija un raksturošana
2022
Smiltsērķšu marafivīruss (SBuMV) ir iepriekš neraksturots, smiltsērkšķus inficējošs vīruss. Tam ir divas atklātās translācijas fāzes (ORF), kur ORF1 kodē poliproteīnu, kas satur četrus proteīnu domēnus, bet ORF2 kodē apvalka proteīnu (CP). Šajā darbā tika izveidotas ekspresijas plazmīdas SBuMV kodētajiem proteīniem, taču E. coli sistēmā izdevās ekspresēt un attīrīt tikai abas CP formas un proteāzes (PRO) domēnu. Tika pārbaudīta PRO aktivitāte, PRO šķelšanas saits un verificēta PRO deubikvitināzes (DUB) aktivitāte. SBuMV mažorais CP E. coli spēj pašsavākties vīrusam līdzīgajās daļinās (VLP), bet minorais CP veido agregātus. Koekspresijas rezultātā, ja abas CP formas ekspresē no vienas plazmī…
Bakteriofāga AP205 apvalka proteīna strukturālie pētījumi
2015
Darbā ar rentgenstruktūranalīzes palīdzību tika noteikta Acinetobacter fāga AP205 apvalka proteīna struktūra 1,9 Å izšķirtspējā. Proteīna vispārējā struktūra ir līdzīga radniecīgo bakteriofāgu iepriekš noteiktajām struktūrām, bet ir vērojamas vairākas būtiskas atšķirības, no kurām nozīmīgākā ir C- un N- galu atrašanās uz kapsīdas virsmas. Iegūtie rezultāti izskaidro AP205 fāga kapsīdu toleranci pret garām insercijām C- un N- galos, kā arī paver ceļu racionālai apvalka proteīna modificēšanai praktiskiem pielietojumiem. Darbs izstrādāts Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centra proteīnu kristalogrāfijas laboratorijā Dr. biol. Kaspara Tāra vadībā.
Augu vīrusu strukturālo proteīnu domēni antigēnu multimerizācijai
2018
Maģistra darba mērķis ir pārbaudīt ekspresēto un attīrīto ApMV un CMV CP N-gala sajūgtos domēnus ar eGFP un PADRE T-šūnu epitopu oligomerizācijas īpašības un imunogenitāti peļu modelī, salīdzinot datus ar veselas vīrusveidīgās daļiņas imunogenitāti, ko varētu izmantot turpmākiem eksperimentiem imunoloģiski nozīmīga epitopa pārbaudē. Maģistra darbs tika izstrādāts no 2016. gada septembra līdz 2018. gada maijam Augu virusoloģijas grupā Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā, Dr. biol. Andra Zeltiņa un Dr. biol. Inas Baļķes vadībā. Darba gaitā, papildus bakalaura darba ietvaros izveidotām konstrukcijām, tika izveidotas vēl divas konstrukcijas, kur CP N-terminālie domēni, papildus eGF…
Bromoviridae dzimtas augu vīrusa nanodaļiņu konstruēšana un raksturošana
2016
Bakalaura darba mērķis bija iegūt VLP E.coli no pilna un par 24 aa N-gala saīsināta CCMV CP VLP un balstoties uz šīm konstrukcijām, izveidot CP konstrukcijas, kas N- vai C- galā satur TT830 peptīda sekvenci. Bakalaura darbs izstrādāts no 2015. gada septembra līdz 2016. gada maijam Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā, Augu virusoloģijas laboratorijā Dr. biol. Andra Zeltiņa un Dr. biol. Inas Baļķes vadībā. Pētījumu objekts ir lopbarības pupiņas raibumu vīruss - CCMV. Bakalaura darba laikā tika izveidotas piecas CCMV CP ekspresijas konstrukcijas - pET42-CCMV, pET42-CCMV–Ntt830, pET42-CCMV–Ctt830, pET42-Δ24CCMV, pET42-Δ24CCMV-Ntt830 un pET42-Δ24CCMV–Ctt830. Ekspresijas pārbaudes an…
Modificētas Lopbarības pupiņas raibuma vīrusam līdzīgās daļiņas vakcīnu konstruēšanai
2018
Maģistra darba mērķis ir izveidot CCMV CP VLP konstrukcijas E.coli, kas paredzētas efektīvākai ķīmisko epitopu pievienošanai uz VLP virsmas un lielākai daļiņu stabilitātei. Maģistra darbs izstrādāts no 2016. gada septembra līdz 2018. gada maijam Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā, Augu virisoloģijas laboratorijā Dr. biol. Andra Zeltiņa un Dr. biol. Inas Baļķes vadībā. Pētījuma objekts ir lopbarības pupiņas raibumu vīruss – CCMV. Maģistra darba laikā tika izveidotas divpadsmit CCMV CP ekspresijas konstrukcijas – pET42-CCMV-G3SKG3, pET4-CCMV-G3SKG3-Ntt830, pET42-CCMV-G3SKG3-Ctt830, pET42-CCMV-SS, pET42-CCMV-Ntt830-SS, pET42-CCMV-Ctt830-SS, pET42-∆24CCMV-SS, pET42-∆24CCMV-Ntt830-…